Pendidikan abad 21 menuntut transformasi paradigma pembelajaran dari sekedar transfer pengetahuan menjadi pengembangan kemampuan berpikir tingkat tinggi (Higher Order Thinking Skills/ HOTS). Penelitian ini bertujuan mengembangkan Lembar Kerja Peserta Didik (LKPD) berbasis Pemberdayaan Berpikir Melalui Pertanyaan (PBMP) pada pembelajaran biologi kelas X semester 1 untuk memberdayakan HOTS. Metode penelitian menggunakan pendekatan Research and Development (R&D) dengan model ADDIE (Analyze, Design, Development, Implementation, Evaluation). Hasil penelitian menunjukkan bahwa LKPD berbasis PBMP yang dikembangkan memenuhi kriteria kelayakan dengan rata-rata skor validasi ahli materi 93,3% (sangat layak), ahli media 96,6% (sangat layak), ahli HOTS menyatakan bahwa soal-soal yang dikembangkan telah sesuai dengan indikator dan aspek HOTS (layak), penilaian guru biologi dengan presentase 85% (sangat layak), dan hasil uji coba skala kecil pada 10 peserta didik kelas X mendapatkan hasil rata-rata 86,8% (sangat layak). Penelitian ini diharapkan dapat menjadi acuan dalam mengembangkan media pembelajaran yang mendorong kemampuan berpikir tingkat tinggi.