Meski internasionalisasi PTKIN telah menjadi agenda strategis Diktis, pemahaman dan implementasinya masih terbatas pada sebagian kecil institusi. Ketimpangan ini mengindikasikan belum adanya kebijakan dan regulasi nasional yang sistemik dan menyeluruh. Padahal, internasionalisasi merupakan strategi vital penguatan mutu, daya saing, dan citra Islam Indonesia yang moderat. Penelitian ini menjawab empat fokus: (1) urgensi internasionalisasi, (2) dukungan kebijakan nasional dan kelembagaan, (3) implementasi di tingkat nasional dan tiga PTKIN unggulan (UIN Jakarta, UIN Sunan Kalijaga, UIN Maliki Malang), serta (4) implikasi terhadap kebijakan, kelembagaan, reputasi, dan daya saing global. Pendekatan kualitatif digunakan dengan desain multikasus berbasis field research Creswell. Data diperoleh melalui observasi, wawancara, dan studi dokumen, lalu dianalisis melalui tahap reduksi, penyajian, dan penarikan kesimpulan, dengan triangulasi sebagai teknik validasi.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa: (1) Internasionalisasi PTKIN penting untuk peningkatan mutu akademik, reputasi global, dan diplomasi keilmuan Islam moderat berbasis epistemologi integratif. (2) Kebijakan nasional berkembang dalam lima fase, direspons PTKIN melalui kebijakan adaptif—UIN Jakarta dengan pluralisme keilmuan, UIN Sunan Kalijaga dengan integrasi-interkoneksi agama dan sains, dan UIN Malang melalui pesantren kampus berbasis jejaring Asia-Pasifik. (3) Implementasi meliputi beasiswa, riset kolaboratif, kelas internasional, akreditasi, dan jejaring akademik, didukung Diktis Kemenag RI. (4) Internasionalisasi berdampak pada transformasi tata kelola, pembentukan International Office, peningkatan mahasiswa asing, publikasi, dan peringkat global.
Penelitian ini menghasilkan teori Institutional Distinctive Flexibility in Internationalization (IDFI), model internasionalisasi yang menekankan fleksibilitas institusi, kekhasan epistemik Islam Indonesia, jejaring berbasis ukhuwah fikriyyah, serta penguatan SDM Muslim berwawasan global. IDFI memperluas teori internasionalisasi pendidikan tinggi dengan menambahkan strategi keenam: peningkatan riset internasional sebagai fondasi transformasi PTKIN menuju research university. Temuan ini relevan untuk negara berkembang, dengan rekomendasi penerapan IDFI melalui kebijakan adaptif, optimalisasi potensi lokal, dan pengembangan prodi berdaya saing global.