Poligami merupakan salah satu pembahasan yang tidak pernah berhenti untuk diperbincangkan, salah satu ulama nusantara yang produktif yaitu KH. Misbah Mustofa. Poligami yaitu pernikahan yang dilakukan oleh seorang laki-laki dengan perempuan lebih dari satu. Poligami sudah ada dari zaman Nabi terdahulu tentunya dengan aturan-aturan pada masa itu. Hingga sekarang permasalahan poligami sudah tidak asing lagi, bahkan di Indonesia sendiri yang melakukan poligami kebanyakan dari kalangan ulama. Seperti Aceh, yang menganut hukum Islam mutlak ini juga membolehkan adanya poligami, bahkan orang tua yang putrinya akan di nikahkan akan dengan senang hati meskipun menjadi istri kedua atau ketiga.
Penulis pada penelitian kali ini menggunakan metode Maudhu’i (tematik) dengan fokus pada QS. an-Nisa’ ayat 3 dan menggunakan kitab tafsir karya KH. Misbah Mustofa yaitu Tafsir al-Iklīl Fī Ma’anī at-Tanzīl dan Tafsīr Tāj al-Muslimīn Min Kalāmi Rabb al-‘Alamīn. Penulis menggunakan kedua tafsir ini karena beberapa sumber mengatakan bahwa penjelasan di dalam kitab Tafsir al-Iklīl Fī Ma’anī at-Tanzīl telah dihapuskan oleh pihak penerbit yaitu penerbit al-Ihsan dari Surabaya, sehingga untuk melengkapi penjelasan yang telah dihapus tersebut penulis mengambil kitab yang satunya yaitu kitab Tafsīr Tāj al-Muslimīn Min Kalāmi Rabb al-‘Alamīn. Serta meneliti tentang metode penafsiran yang digunakan oleh KH. Misbah Mustofa dalam menafsirkan QS. An-Nisa ayat 3 tentang poligami. Data penelitian diperoleh melalui dokumentasi yaitu dari buku dan kitab karya Misbah Mustofa, skripsi-skripsi terkait, jurnal terkait untuk melengkapi. Selanjutnya data tersebut dianalisis dengan metode deskriptif-analitik dimana sumber utamanya yaitu kitab Tafsir al-Iklīl Fī Ma’anī at-Tanzīl dan Tafsīr Tāj al-Muslimīn Min Kalāmi Rabb al-‘Alamīn karya KH. Misbah Mustofa.
Hasil penelitian menyimpulkan bahwa (1) KH. Misbah Mustofa membolehkan adanya poligami, karena suatu bentuk keadilan untuk laki-laki atas perempuan. Menurutnya, perempuan telah mengurangi hak dari laki-laki dengan adanya menstruasi yang menyebabkan laki-laki tidak mendapatkan haknya. (2) KH. Misbah Mustofa dalam menafsirkan QS. An-Nisa : 3 tentang poligami ini menggunakan metode penafsiran tahlili yaitu dengan menguraikan kosa kata QS. an-Nisa ayat 3, kemudian memberikan sebab turunnya ayat, dan ditambah dengan pemikiran dari KH. Misbah Mustofa sendiri karena tafsir ini tergolong tafsir bil Ra’yi, namun tidak dicantumkannya keterkaitan antar ayat walaupun dalam QS. an-Nisa ayat 3 ini terdapat pembahasan tentang anak yatim.