Penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan problem penguasaan siswa pada materi Pendidikan Agama Islam di masa pandemi Covid-19 di SDN 2 Purbasari Karangjambu Purbalingga dan berupaya menemukan solusi guna mengatasi permasalahan-permasalahan yang muncul dalam penguasaan siswa pada materi Pendidikan Agama Islam di masa pandemi di SDN 2 Purbasari Karangjambu Purbalingga. Pendekatan pada penelitian ini yaitu menggunakan pendekatan kualitatif deskriptif dengan jenis penelitian lapangan (field research). Data yang didapatkan berasal dari metode Triangulasi data yaitu dengan observasi, wawancara dan dokumentasi. Subjek dalam penelitian ini yaitu Kepala Sekolah SD Negeri 2 Purbasari, Guru Pendidikan Agama Islam, Siswa dan Orang tua. Hasil dari penelitian ini bahwa, terdapat beberapa problem penguasaan siswa pada materi Pendidikan Agama Islam saat pandemi,yaitu; (1) Keterbatasan media pembelajaran. (2) Keterbatasan orang tua dalam mendampingi. (3) Keterbatasan ekonomi orang tua yang menyebabkan sarana dan prasarana pendukung dalam kegiatan pembelajaran seperti handphone dan kuota internet peserta didik tidak terpenuhi. (4) Tekanan psikologis siswa seperti stres dan cemas. Solusi sekolah dalam mengatasi problem tersebut adalah guru melakukan Home visit, rutin berkomunikasi dengan orang tua siswa melalui Whatsapp Group agar sama-sama meluangkan waktu dalam mendampingi, siswa yang tidak mempunyai Handphone dan kuota internet di anjurkan datang ke sekolah, guru dan orang tua bekerja sama untuk menciptakan suasana belajar jarak jauh yang nyaman.