Era pengetahuan di abad 21 menuntut inovasi serta penggunaan teknologi secara maksimal. Selain itu, menuntut siswa untuk menguasai berbagai keterampilan salah satunya keterampilan berpikir kritis. Salah satu materi biologi yang dianggap sulit oleh siswa adalah materi mutasi. Oleh karena itu peneliti mengembangkan multimedia interaktif berbasis android untuk melatih kemampuan berpikir kritis pada materi mutasi. Jenis penelitian ini yaitu research and development (R&D), penelitian ini dikembangkan menggunakan model pengembangan ADDIE. Sampel pada penelitian ini yaitu 10 siswa MAN 2 Semarang dan teknik sampling yang pakai yaitu teknik random sampling. Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa multimedia interaktif berbasis android sangat layak digunakan sebagai bahan ajar. Hal ini dapat diketahui dari nilai hasil uji kelayakan oleh ahli media sebesar 76%, ahli materi sebesar 81,81%, ahli berpikir kritis oleh guru biologi sebesar 91,42%, tanggapan guru sebesar 91,61%, dan hasil respon siswa terhadap aplikasi multimedia interaktif sebesar 92,66%.