Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengungkap tentang kurikulum PAI berbasis pesantren diantaranya meliputi tujuan kurikulum PAI, konten kurikulum PAI, pengalaman belajar dan kompetensi orientasi siswa Berbasis Pesantren. Tempat penelitian ini di MI Ya BAKII 01 Kesugihan Cilacap. Penelitian ini menggunakan penelitian Kualitatif dengan pendekatan studi kasus, menggunakan tringulasi teknik, sumber dan informan. Data yang penulis peroleh adalah dengan wawancara, observasi dan dokumentasi. Kemudian dari setiap data tersebut dianalisis dengan menggunakan siklus interaktif dengan komponen reduksi data, sajian data serta penggambaran kesimpulan.
Hasil dari penelitian menunjukan bahwa Terdapat tujuan kurikulum PAI yang bersifat umum yakni pembentukan karakter siswa dan bersifat khusus yakni sebagai penunjang mata pelajaran madrasah. Konten kurikulum PAI berbasis pesantren yaitu kegiatan-kegiatan yang linier dengan pondok pesantren Al Ihya Ulumaddin Kesugihan sebagai pesantren yang menaungi yayasan Ya BAKII seperti; Tahfidzul Qur’an, Muroja’ah, Belajar Ceramah, Berzanji (Sholawatan) dan Belajar Al-Qur’an dan Doa. Pelaksanaan kurikulum PAI berbasis pesantren di MI Ya Bakii 01 kesugihan dilaksanakan didalam kelas dan diluar kelas, setiap hari sesuai dengan jadwal yang telah ditentukan.Orientasi pembelajaran PAI berbasis pesantren dilakukan dengan memprioritaskan sikap kedisiplinan dan akhlak di madrasah maupun di luar madrasah