Flacourtia merupakan salah satu tumbuhan yang termasuk dalam famili Salicaceae. Terdapat 4 spesies Flacourtia koleksi Kebun Raya Bogor antara lain: F. indica (2), F. inermis (5), F. jangomas (6), F. rukam (13), namun terdapat satu genus yang belum teridentifikasi sampai ke tingkat spesies, yaitu Flacourtia sp. dengan nomor koleksi II.O.IV.A.18 asal Sulawesi Tengah. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi sampel Flacourtia sp. menggunakan pendekatan molekuler DNA barcode rbcL dan matK. Tahapan penelitian meliputi pengambilan sampel, ekstraksi DNA, PCR (Polymerase Chain Reaction), elektroforesis, visualisasi DNA, sekuensing DNA dan analisis data hasil sekuensing. Analisis data dilakukan dengan merekonstruksi pohon filogenetik mengguanakan metode Neighbor Joining dengan parameter Jukes cantor + Gamma (rbcL) dan Tamura 3-parameter (matK). Dari hasil penelitian, identifikasi molekuler menggunakan sekuen rbcL dan matK menunjukkan bahwa sampel Flacourtia sp. termasuk ke dalam genus Scolopia. Sedangkan, identifikasi spesies menggunakan pengamatan secara morfologi dan herbarium mampu menunjukkan bahwa sampel Flacourtia sp. merupakan spesies Scolopia luzonensis.