Karakterisasi morfologi dan DNA barcoding Durio Macrantha Kosterm : koleksi Kebun Raya Bogor

Rusydina, Diyana Sabila (2023) Karakterisasi morfologi dan DNA barcoding Durio Macrantha Kosterm : koleksi Kebun Raya Bogor. Undergraduate (S1) thesis, Universitas Islam Negeri Walisongo Semarang.

[thumbnail of Skripsi_1908016051_Diyana_Sabila_Rusydina] Text (Skripsi_1908016051_Diyana_Sabila_Rusydina)
Skripsi_1908016051_Diyana_Sabila_Rusydina.pdf - Accepted Version
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives.

Download (3MB)

Abstract

Durio macrantha Kosterm. (Durian Dok) ditemukan pada tahun 1981 di Taman Nasional Gunung Leuser, Sumatra Utara. Spesies durian ini berhasil dikonservasikan di Kebun Raya Bogor (KRB) pada tahun 1994. Penelitian ini penting dilakukan karena adanya persamaan pada bagian morfologi D. macrantha dengan spesies D. zibethinus serta belum adanya data molekuler yang terdeposit di NCBI. Sehingga penelitian ini bertujuan untuk mengkarakteriasai secara morfologi dan DNA Barcoding D. macrantha koleksi KRB menggunakan sekuen rbcL dan ITS yang berfungsi untuk mengetahui profil dari kedua sekuen tersebut pada DNA D. macrantha. Penelitian ini menggunakan dua metode yaitu metode morfologi dan molekuler dengan DNA Barcoding. Hasil karakteriasasi morfologi yang diperoleh dari D. macrantha koleksi KRB yaitu organ vegetatif tumbuhan yaitu daun memiliki dua warna yang berbeda pada permukaan atas dan bawah, susunan daun berselang-seling, terdapat swollen pada bagian tangkai, tekstur permukaan batang kasar, arah pertumbuhan batang lurus dengan arah percabangan menyebar, dan bentuk tajuk piramida. Terdapat karakter khusus yang membedakan dengan tumbuhan pada genus lain yaitu adanya trikoma pada bagian bawah daun. Hasil karakterisasi profil sekuen rbcL D. macrantha menunjukan panjang 563 bp dengan presentase komposisi nukleotida (banyak mengandung nukleotida T dan A) yang terdiri dari T: 27,9%, C: 21,7%, A: 27,9, G: 22,6 %. Sedangkan karakterisasi profil sekuen ITS D. macrantha menunjukan panjang 846 bp dengan presentase komposisi nukleotida (banyak mengandung nukleotida G dan C) yang terdiri dari T:13,7%, C:37,3%, A:16,9%, G:32,2%. Sementara itu, wilayah sekuen ITS pada D. macrantha yang diperoleh terbagi menjadi 3 yaitu ITS 1 dari panjang basa 103-392 bp, ITS 5,8 dari 393-555 bp, dan ITS 2 dari 556-790 bp.

Abstract
Durio macrantha Kosterm. (Durian Dok) was discovered in 1981 in Gunung Leuser National Park, North Sumatra. This durian species was successfully conserved in the Bogor Botanical Gardens (KRB) in 1994. This research was important because of the similarity in the morphology of D. macrantha with the species D. zibethinus and the absence of molecular data deposited in NCBI. So this study aims to characterize morphologically and DNA Barcoding of D. macrantha in the KRB collection using rbcL and ITS sequences which function to determine the profile of the two sequences in D. macrantha DNA. This study used two methods, namely morphological and molecular methods with DNA Barcoding. The results of the morphological characterization obtained from D. macrantha KRB collection are the vegetative organs of plants namely the leaves have two different colors on the upper and lower surfaces, the arrangement of the leaves is alternate, there is swelling on the stalk, the texture of the stem surface is rough, the growth direction of the stem is straight with the direction of the branching spreads, and the shape of the statue's crown. There is a special character that distinguishes it from plants in other genera, namely the presence of trichomes on the underside of the leaves. The results of the characterization of the D. macrantha rbcL sequence profile showed a length of 563 bp with a percentage of nucleotide composition (containing many T and A nucleotides) consisting of T: 27.9%, C: 21.7%, A: 27.9, G: 22 .6%. While the characterization of D. macrantha ITS sequence profile showed a length of 846 bp with a percentage of nucleotide composition (containing many G and C nucleotides) consisting of T: 13.7%, C: 37.3%, A: 16.9%, G: 32.2%. Meanwhile, the ITS sequence region in D. macrantha obtained was divided into 3, namely ITS 1 from 103-392 bp, ITS 5.8 from 393-555 bp, and ITS 2 from 556-790 bp.

Item Type: Thesis (Undergraduate (S1))
Uncontrolled Keywords: Durio macrantha; karakterisasi morfologi; DNA Barcoding; rbcL; ITS
Subjects: 500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology
500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology > 575 Specific parts of and physiological systems in plants
Divisions: Fakultas Sains dan Teknologi > 46201 - Biologi
Depositing User: Mohamad Irfan Sahroni
Date Deposited: 10 Oct 2023 08:50
Last Modified: 10 Oct 2023 08:50
URI: https://eprints.walisongo.ac.id/id/eprint/20739

Actions (login required)

View Item
View Item

Downloads

Downloads per month over past year

View more statistics