Keji (Staurogyne elongata [Blume] Kuntze) merupakan tumbuhan yang dapat digunakan sebagai obat tradisional. Penelitian tentang tumbuhan Staurogyne elongata masih sangat terbatas. Oleh karena itu, penelitian mengenai senyawa yang terkandung pada daun muda dan daun dewasa tumbuhan keji sangat penting dilakukan. Tujuan penelitian ini yaitu untuk mengidentifikasi variasi senyawa metabolit sekunder serta untuk mengidentifikasi perbedaan senyawa metabolit sekunder diantara daun muda dan daun dewasa tumbuhan keji (Staurogyne elongata [Blume] Kuntze). Sampel daun keji diambil dari Desa Domiyang, Kecamatan Paninggaran, Kabupaten Pekalongan. Metode penelitian menggunakan Gas Chromatography-Mass Spectrometry untuk menganalisis senyawa metabolit sekunder yang terkandung pada daun muda dan daun dewasa tumbuhan keji. Hasil penelitian menunjukkan bahwa jumlah senyawa metabolit sekunder pada daun muda dan daun dewasa tumbuhan keji adalah 22 dan 16 senyawa. Sementara itu, terdapat 12 senyawa yang sama teridentifikasi pada daun muda dan daun dewasa dengan kadar yang berbeda. Senyawa phytol dan Octadecanoic acid, 2- hydroxy-1-(hydroxymethyl) ethyl ester dapat dimungkinkan menjadi senyawa penanda pada daun muda. Senyawa stigmasterol dapat dimungkinkan menjadi senyawa penanda pada daun dewasa.