Pemberian alokasi dana desa yang besar memiliki konsekuensi akan terjadinya kecurangan yang dilakukan oleh pihak-pihak tertentu. Pencegahan fraud terus dilakukan pemerintah melalui kebijakan-kebijakan, namun kebijakan tersebut belum cukup untuk mengatasi permasalahan fraud. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui faktor yang mempengaruhi pencegahan fraud. Penelitian ini menggunakan jenis penelitian kuantitatif. Sampel yang digunakan dalam peneitian ini sebanyak 55 orang yang merupakan aparat desa yang ada di Kecamatan Jumapolo. Teknik pengumpulan data menggunakan metode kuisioner berupa pernyataan yang disebar kepada responden dengan menggunakan teknik purposive sampling. Analisis data dilakukan dengan pengolahan data menggunakan SPSS Statistics V.26.
Berdasarkan hasil penelitian, dapat disimpulkan bahwa variabel sistem pengendalian internal berpengaruh positif secara signifikan terhadap pencegahan fraud pengelolaan dana desa se-kecamatan Jumapolo. Sedangkan variabel whistleblowing system dan moralitas individu tidak berpengaruh terhadap pencegahan fraud pengelolaan dana desa se-kecamatan Jumapolo. Besarnya koefisien determinasi (R square) adalah 28,2%. Hal ini berarti ketiga variabel independen hanya mampu menjelaskan sebesar 28,2% variabel dependen, sisanya dipengaruhi oleh variabel lain yang tidak dimasukkan dalam model regresi dalam penelitian ini.