Pada penelitian ini membahas tentang problematika pembelajaran pendidikan agama Islam bagi anak-anak Suku Samin di SMPN 1 Margomulyo Bojonegoro. Dimana sekolah tersebut merupakan sekolah Standart Nasional yang terdapat dari beberapa siswanya berasal dari masyarakat keturunan Suku Samin dimana yang masih menganut kepercayaan agama Adam. Dulu yang awalnya tidak diperbolehkan mendidik anak melalui pendidikan formal (sekolah) ataupun dalam pendidikan non formal (kursus). Akan tetapi dengan seiring perkembangan zaman dimana masyarakat Suku Samin sudah memiliki kesadaran untuk menyekolahkan anak-anak mereka di lembaga formal (sekolah) dan sudah mau menerima adanya pendidikan formal dan bahkan membiarkan anak-anak mereka untuk belajar pendidikan agama Islam.
Penelitian ini merupakan jenis penelitian lapangan dengan menggunakan pendekatan kualitatif dengan jenis penelitian studi kasus. Adapun dalam mengumpulkan data penelitian ini menggunakan metode observasi, wawancara, dan dokumentasi. Sedangkan teknik analisis data yang digunakan pada penelitian ini yaitu reduksi data, penyajian data, dan penarikan kesimpulan. Hasil dari penelitian ini menunjukkan bahwa dalam pelaksanaan pendidikan agama Islam disekolah SMPN 1 Margomulyo, Bojonegoro masih ditemukan problematika-problematika yang menghambat keberhasilan dalam pendidikan agama Islam, Adapun problematika yang dihadapi oleh anak-anak Suku Samin yaitu adanya problematika dalam teologi, kultur budaya dan sosial ekonomi.