Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbedaan motivasi belajar bahasa Arab siswa program asrama dan non asrama pada tiga Madrasah Aliyah Negeri di Yogyakarta. Tujuan akhirnya adalah mendapatkan hasil uji perbedaan dari penerapan program asrama dan non asrama terhadap motivasi belajar bahasa Arab siswa. Jenis penelitian ini adalah pendekatan kuantitatif dengan penelitian komparatif. Populasi dalam penelitian ini adalah siswa kelas 11 dan 12 MAN 1 Yogyakarta, MAN 2 Yogyakarta dan MAN 3 Sleman Yogyakarta. Sampel penelitian ini yaitu 48 siswa dari masing-masing madrasah. Teknik pengumpulan data menggunakan angket motivasi belajar bahasa Arab siswa. teknik analisis yang digunakan yaitu uji-T dan Uji one way anova dengan sebelumnya dilakukan uji prasyarat. Hasil penelitian ini diperoleh bahwa 1) motivasi belajar bahasa Arab siswa program asrama MAN 1 dan MAN 3 tidak memiliki perbedaan yang signifikan dibuktikan dengan nilai t-hitung sig. (2-tailed) 0,595 > 0,05. 2) motivasi belajar bahasa Arab siswa MAN 1 dan MAN 2 tidak memiliki perbedaan yang signifikan dibuktikan dengan nilai t-hitung sig. (2-tailed) 0,426 > 0,05. 3) motivasi belajar bahasa Arab siswa MAN 2 dan MAN 3 tidak memiliki perbedaan yang signifikan dibuktikan dengan nilai t-hitung sig. (2-tailed) 0,732 > 0,05. 4) motivasi belajar bahasa Arab antara MAN 1, MAN 2, dan MAN 3 tidak memiliki perebedaan yang signifikan dibuktikan dengan nilai sig. Anova 0,699 > 0,05.