Ikan Nila (Oreochromis niloticus L) adalah salah satu produk perikanan air tawar yang menjanjikan untuk dibudidaya dan mempunyai nilai ekonomi yang cukup tinggi seiring dengan meningkatnya permintaan pasar dari tahun ke tahun. Budidaya ikan Nila juga tidak terlepas dari serangan biologis seperti adanya gangguan penyakit yang salah satunya disebabkan oleh parasit. Endoparasit merupakan kelompok parasit yang dapat menjadi tantangan yang cukup besar bagi kegiatan budidaya. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis jenis mikroorganisme endoparasit dan menghitung prevalensi intensitas yang menginfeksi ikan nila. Penelitian ini menggunakan metode survei dan pengambilan sampel menggunakan simple random sampling dengan total sampel sebanyak 30 ekor. Hasil identifikasi endoparasit pada usus dan lambung ikan nila ditemukan empat jenis parasit yaitu Crepidostomum sp., Rhadinorhynchus dorsoventrospinosus, Anisakis simplex, dan Camallanus sp., dengan nilai prevalensi 3,3% yang termasuk dalam kategori kadang dan intensitas 1 individu per ekor dengan kategori rendah.