Keterampilan kolaborasi dan literasi sains sangat diperlukan dalam dunia pendidikan sebagai upaya untuk menjadikan siswa memiliki kemampuan abad ke-21 yang ditinjau berdasarkan kemampuan akademik siswa. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui bagaimana hubungan keterampilan kolaborasi dan kemampuan akademik dengan literasi sains siswa pada pembelajaran biologi Kelas XI IPA MAN 1 Kota Semarang. Penelitian ini menggunakan penelitian kuantitatif korelasional. Populasi pada penelitian ini adalah siswa Kelas XI IPA MAN 1 Kota Semarang. Teknik pengambilan sampel menggunakan teknik purposive sampling. Teknik pengumpulan data menggunakan kuesioner untuk variabel keterampilan kolaborasi, dokumentasi nilai untuk variabel kemampuan akademik, dan tes untuk literasi sains. Pengujian hipotesis pertama dan kedua menggunakan korelasi product moment, dan untuk hipotesis ketiga menggunakan korelasi ganda. Hasil penelitian menunjukan: Hubungan antara keterampilan kolaborasi dengan literasi sains positif dengan nilai signifikansi 0,05 > 0,008, besar nilai korelasi 0,312 (korelasi lemah). Hubungan antara kemampuan akademik dengan literasi sains positif dengan nilai signifikansi 0,00 ˂ 0,05, besar nilai korelasi 0,422 (korelasi cukup kuat). Hubungan antara keterampilan kolaborasi dan kemampuan akademik dengan literasi sains siswa pada pembelajaran biologi positif dengan nilai signifikansi 0,00 ˂ 0,05, besar nilai korelasi 0,448 (korelasi cukup kuat).