Pemanfaatan media pembelajaran digital sangat selaras dengan penerapan Kurikulum Merdeka, yang menitikberatkan pada pembelajaran berbasis teknologi. Pemanfaatan berbagai media digital dengan memanfaatkan kemajuan teknologi menjadi salah satu strategi pembelajaran yang banyak digunakan di abad ke-21. Hal tersebut berkaitan erat dengan literasi digital. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan dan mengevaluasi kelayakan media, serta untuk mengetahui tanggapan guru dan siswa terhadap penggunaan media pembelajaran berupa aplikasi mobile learning berbasis pendekatan MIKiR untuk melatih literasi digital siswa kelas XI dalam materi sel di MA Salafiyah Ahmad Said Kudus. Jenis penelitian yang digunakan pada penelitian ini adalah penelitian pengembangan (Research and Development) dengan model ADDIE (Analysis, Design, Develope, Implementation, Evaluation). Teknik pengumpulan data yang dilakukan pada penelitian ini meliputi wawancara dengan guru biologi, angket respon siswa dan validasi oleh beberapa ahli. Persentase yang didapatkan dari validasi ahli materi sejumlah 82,22%, ahli media sejumlah 71,53%, ahli literasi digital sejumlah 87,5%, ahli pendekatan pembelajaran sejumlah 93,75%, dan penilaian dari guru Biologi sejumlah 80%. Uji keterbacaan dari respon siswa sebesar 80,18%. Berdasarkan perolehan tersebut, media aplikasi yang dikembangkan layak digunakan untuk pembelajaran biologi yang dapat melatih literasi digital siswa.