Dalam outlook perbankan syariah tahun 2011 disebutkan, salah satu yang menjadi permasalahan dalam perbankan syariah adalam implementasi kebijakan, praktek dan mekanisme pada aktivitas pembiayaan dan operasional. Hal ini tercermin dari tingkat pengaduan nasabah yang diterima oleh Bank. Pada tahun 2012 pembiayaan yang diberikan Badan Usaha Syariah dan Unit Usaha Syariah mengalami peningkatan, peningkatan tersebut juga terjadi pada BMT An-nawawi Purworejo, khususnya pada pembiayaan Mudharabah. Sanpai saat ini pembiayaan Mudharabah di BMT An-nawawi Purworejo mencapai 14,3 miliar dari dua ribu nasabah yang melakukan pembiayaan Mudharabah. Dengan peningkatan pembiayaan yang terjadi di BMT An-nawawi Purworejo dituntut untuk melakukan system Praktek pembiayaan Mudharabah yang memadai agar permasalahan yang terjadi dapat diminimalisir bahkan dihindari. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui praktek pembiayaan Mudharabah dan system bagi hasil Mudharabah di BMT An-nawawi Purworejo.
Penelitian ini merupakan jenis penilitian kualitatif yang menggunakan analisis deskriptis, yaitu mendeskriptiskan data-data yang peneliti mengumpulkan baik dari hasil wawancara, observasi maupun dokumentasi tentang Praktek pembiayaan Mudharabah di BMT An-nawawi Purworejo.
Hasil penelitian menunjukan bahwa praktek pembiayaan Mudharabah di BMT An-nawawi Purworejo sesuai dengan Fatwa Dewan Syariah Nasional tentang pembiayaan Mudharabah. Praktek pembiayaan Mudharabah di BMT An-nawawi Purworejo sudah memenuhi unsur-unsur tersebut. Adanya pemisahan fungsi dan tugas untuk masing-masing bagian, terdapat penulisan tanggal, nomor pembiayaan, pengisian kolom secara urut, dan paraf dari petugas yang bersangkutan didokumen pembiayaan Mudharabah, serta karyawan yang kompeten dibagian pembiayaan membuat prosedur pembiayaan mudharabah telah diterapkan di BMT An-nawawi Purworejo berjalan dengan baik.