Pengendalian internal merupakan sistem dan prosedur yang digunakan perusahaan untuk mencapai sasaran dan tujuan yang diinginkan, yaitu menghasilkan laporan keuangan yang akurat serta mendorong ketaatan terhadap kebiajakn dan peraturan yang telah ditetapkan. sistem pengendalian mencegah penyimpangan dana pembiayaan pada KSPPS Amanah Usaha Mulia Magelang dapat diambil sebagai berikut :
Sistem Pengendalian Internal KSPPS Amanah Usaha Mulia Magelang. Sistem pengendalian internal yang digunakan KSPPS Amanah Usaha Mulia Magelang dalam pencegah penyimpangan dana pembiayaan yaitu dengan melakukan pengecekan rutin untuk mencegah resiko yang tidak diinginkan. setiap pegawai dituntut untuk jujur dan bertanggungjawab dengan tugas dan wewenangnya masing-masing, dan paling penting semua pegawai saling berkerjasama untuk mencapai tujuan yang telah ditetapkan KSPPS Amanah Usaha Mulia Magelang.
Efektivitas sistem pengendalian internal KSPPS Amanah Usaha Mulia Magelang. Keefektivitasan sistem pengendalian internal KSPPS Amanah Usaha Mulia Magelang sudah berjalan sesuai dengan perencanaan yang telah dituju, dalam pengoperasiannya juga sudah sesuai dengan prinsip dan komponen di pengendalian internal. Prinsip dan komponen tersebut antara lain : pegawai yang berkualitas dan dapat dipercaya, pemisahan wewennag, pengawasan, penetapan tanggungjawab secara perseorangan, pencatatan yang seksama dengan segera, penjagaan fisik, pemisaan oleh petugas yang bebas dari tugas rutin merupakan prinsip pengendalian internal dan komponen pengendalian meliputi lingkungan pengendalian, penentuan risiko manajemen, aktivitas pengendalian, informasi dan komunikasi dan pemantauan.