Penelitian ini dilatar belakangi oleh bahan ajar yang kurang bervariasi, yang menyebabkan pemahaman peserta didik pada pembelajaran Biologi khususnya keanekaragaman hayati di sekolah MA Islamiyah Attanwir termasuk dalam kategori kurang. Bahan ajar yang mendukung materi keanekaragaman hayati salah satunya adalah buku petunjuk praktikum. Hal ini menyebabkan peneliti mengembangkan bahan ajar berupa buku petunjuk praktikum berbasis inkuiri dilengkapi word square berintegrasi sains dan Islam pada materi keanekaragaman hayati kelas X IPA A2 di MA Islamiyah Attanwir Bojonegoro. Jenis penelitian ini adalah research and development (R&D) dengan model ADDIE model ini terdiri dari lima fase atau tahapan utama, yaitu: (A)nalysis, (D)esign, (D)evelopment, (I)mplementation, dan (E)valuation. Penelitian dan pengembangan ini dibatasi hanya sampai tahap implementasi skala kecil. Uji kelayakan buku petunjuk praktikum ini yaitu dari ahli materi, ahli integrasi, ahli media, dan guru Biologi. Hasil penilaian kelayakan buku petunjuk praktikum dari dosen ahli dan guru Biologi memperoleh kriteria sangat valid dengan presentase ahli materi I 85%, ahli materi II 80%, ahli integrasi 100%, ahli media 78% dan guru Biologi 88%. Apabila dirata-rata maka hasil penilaian validasi kelayakan 86,2%, dengan kriteria sangat layak. Sedangkan untuk tanggapan peserta didik skala kecil terhadap buku petunjuk praktikum 81% dengan kriteria baik atau layak.