Penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan sistem manajemen laboratorium fisika dan kendalanya pada SMA/MA di Pati. Pengambilan sampel dilakukan dengan teknik purposive sample. Data penelitian merupakan data kualitatif, didasarkan pada bebera pakomponen manajemen laboratorium fisika, yaitu: (1) Perencanaan; (2) Pengorganisasian; (3) Pelaksanaan; (4) Pengawasan dan Evaluasi. Data berupa dokumen laboratorium yang didapatkan dengan kuesioner, wawancara, observasi dan dokumentasi. Data dianalisis secara deskripstif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa manajemen laboratorium fisika SMA/MA berdasarkan sekolah yang menjadi objek penelitian di Kabupaten Pati memiliki kriteria Baik dengan persentase 70,85%. Kendala yang terdapat dalam sistem manajemen laboratorium fisika SMA/MA di Pati yaitu, keterbatasan tersediannya tenaga laboratorium mencakup laboran dan teknisi yang sesuai dengan kriteria kompetensinya. Manajemen laboratorium di sekolah dapat terwujud dan terlaksana dengan baik jika memenuhi kriteria yang terdapat dalam empat perangkat manajemen laboratorium yaitu perencanaan, pengorganisasian, pelaksanaan dan pengawasan serta evaluasi. Dengan demikian, sistem manajemen laboratorium fisika SMA/MA di Pati memiliki kriteria Baik dan masih mengalami kendala dalam pelaksanaanya.