Kebugaran jasmani merupakan kemampuan tubuh seseorang untuk dapat melakukan aktivitas sehari-hari tanpa merasa lelah yang berlebih. Kebugaran jasmani memiliki peranan penting yang berkaitan dengan performa, produktivitas, dan kualitas hidup seseorang terutama bagi usia sekolah dalam proses belajar dan masa depannya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan kebiasaan sarapan, tingkat stres dan status gizi terhadap kebugaran jasmani siswa di SMP berbasis Pondok Pesantren Binaul Ummah Kabupaten Kuningan. Pengukuran kebiasaan sarapan dilakukan dengan kuesioner kebiasaaan sarapan, tingkat stres menggunakan kuesioner Depression Anxiety Stress Scale (DASS-21), status gizi berdasarkan IMT/U dan kebugaran jasmani melaui single test. Metode yang digunakan yaitu cross sectional dengan melibatkan sampel sebanyak 74 siswa yang dipilih secara stratified random sampling. Analisis statistik dilakukan melalui uji gamma dan regresi logistik ordinal pada program aplikasi SPSS. Hasil penelitian menunjukkan bahwa mayoritas responden memiliki kebiasaan sarapan baik sebanyak 35 siswa (47,3%), stres normal yaitu 38 siswa (51,4%), status gizi baik sebanyak 47 siswa (63,5%) dan kebugaran jasmani kurang yaitu 39 siswa (52,7%). Berdasarkan hasil uji gamma menunjukkan tidak ada hubungan kebiasaan sarapan dengan kebugaran jasmani (p = 0,077), ada hubungan tingkat stres dengan kebugaran jasmani (p = 0,000) dan ada hubungan status gizi dengan kebugaran jasmani (p = 0,003). Status gizi merupakan faktor yang paling berpengaruh terhadap kebugaran jasmani pada penelitian ini yaitu 4,51 kali.