Keamanan informasi merupakan hal penting dalam komunikasi digital, terutama dalam penyampaian pesan rahasia. Salah satu solusi yang digunakan untuk menjaga kerahasiaan pesan adalah dengan kriptografi. Penelitian ini bertujuan untuk mengimplementasikan metode sandi kotak yang dikombinasikan dengan caesar cipher dalam bentuk aplikasi berbasis GUI (Graphical User Interface) menggunakan MATLAB sebagai alat bantu komputasi. Proses enkripsi dalam sistem ini dilakukan dengan dua tahap, yaitu penyandian huruf menggunakan caesar cipher terlebih dahulu, kemudian hasilnya dikonversikan menjadi simbol sandi kotak. Sebaliknya, dekripsi dilakukan dengan membaca simbol sandi kotak menjadi huruf, lalu dilakukan dekripsi caesar berdasarkan kunci yang sama. Adapun bentuk matematis proses enkripsi pesan menggunakan sandi kotak dan caesar cipher yaitu C = S(E(P, K)), proses dekripsi yaitu P = D(S−1(C), K). Hasil penelitian menunjukkan bahwa kombinasi kedua metode tersebut mampu meningkatkan kerahasiaan pesan dengan pendekatan ganda: transformasi teks dan konversi visual. Selain itu, GUI yang dikembangkan memberikan kemudahan bagi pengguna dalam memahami proses kriptografi secara interaktif dan visual. Penelitian ini juga menunjukkan bahwa kriptografi klasik masih relevan untuk tujuan edukatif dan aplikasi dasar dalam pengamanan data.