Manajemen pembelajaran baca tulis Al-Qur’an merupakan hal yang sangat penting dalam sebuah lembaga pendidikan, khususnya lembaga pendidikan formal. Hal ini dilatarbelakangi oleh kurang seimbangnya jam pelajaran pendidikan agama Islam di sekolah formal. Studi ini dimaksudkan untuk menjawab permasalahan: (1) bagaimana manajemen perencanaan pembelajaran baca tulis Al-Qur’an di SD Islam Hidayatullah (2) bagaimana manajemen pelaksanaan pembelajaran baca tulis Al-Qur’an di SD Islam Hidayatullah (3) bagaimana manajemen evaluasi pembelajaran baca tulis Al-Qur’an di SD Islam Hidayatullah . Penelitian ini merupakan bagian dari jenis penelitian yang menggunakan pendekatan kualitatif. Pendekatan kualitatif ini memusatkan perhatian pada prinsip-prinsip umum yang mendasarkan pada perwujudan satuan-satuan. Data yang dibutuhkan dalam penelitian ini diperoleh melalui metode wawancara, dokumentasi, dan observasi. Sedangkan analisis data yang digunakan adalah analisis deskriptif kualitatif.
Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa Pertama, Perencanaan manajemen pembelajaran baca tulis Al-Qur’an di SD Islam Hidayatullah Semarang cukup baik sekali. Hal ini dapat dilihat dengan adanya upaya untuk mewujudkan tujuan pembelajaran yang sistematis yang mencakup pengembangan sarana, kualitas guru, dan kualitas siswa. Kedua, pelaksanaan manajemen pembelajaran baca tulis Al-Qur’an yang dilaksanakan di SD Islam Hidayatullah Semarang sangat baik sekali. Hal ini dibuktikan dengan pemilihan metode yang berkesesuaian dengan materi pelajaran serta kebutuhan dan kondisi kemampuan siswa. Ketiga, evaluasi yang dilaksanakan oleh SD Islam Hidayatullah Semarang tidak lain sebagai upaya untuk meningkatkan kualitas internal sekolah (terkait dengan kualitas guru dan siswa) dan kualitas sekolah di mata eksternal. Relevansi dari manajemen pembelajaran dengan optimalisasi hasil belajar dapat dibuktikan dengan banyaknya siswa yang membaca dan menulis serta hafal juz amma dalam Al-Qur'an, hafalan doa-doa sebelum belajar, hafalan surat-surat pendek diwaktu apel pagi, yang dilakukan sebelum jam pelajaran dan sesudah jam pelajaran sebagai kegiatan extra sangat menunjang proses pembelajaran baca tulis Al-Qur’an. Khususnya pada pencapaian membaca dan menulis Al-Qur'an dalam pemahaman ibadah. Karena dibimbing secara langsung oleh guru yang dari segi kuantitas dan kompetensinya sangat memadai dalam pencapaian tujuan sekolah membentuk generasi yang qur’ani.
Kepala sekolah hendaknya melakukan pengamatan kepada aktivitas guru dalam segi Silabus maupun RPP para guru, yang berkaitan dengan proses perencanaan pembelajaran baca tulis Al-Qur’an, agar ketika terdapat kekurangan dapat diperbaiki hingga tujuan yang diharapkan dapat tercapai.